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按照條約規(guī)定，洋商販運洋貨入內(nèi)地銷售或從內(nèi)地收購?fù)霖洺隹冢碛忻庥诶U納沿途貨物通過稅厘金的優(yōu)待。洋貨無論自任一口岸進口，在繳納進口稅和子口稅（數(shù)額為條約關(guān)稅率的一半）之后，即可將貨物運往內(nèi)陸任何地區(qū)，沿途不再繳納任何費用。與此相應(yīng)，出口土貨只需在繳納子口稅后即可將貨物由內(nèi)陸任何地區(qū)運往口岸，沿途不再納稅。（但鴉片不得以子口稅單或其他證件免稅運往內(nèi)陸）鑒于在內(nèi)地包括除口岸以外的其他所有地區(qū)，厘金關(guān)卡遍布于主要運輸線上，子口稅制度對洋商而言獲益匪淺。利用子口稅單舞弊的行為很快出現(xiàn)，例如以子口稅單為護符進行內(nèi)貿(mào)生意，或者干脆出售子口稅單。19世紀60年代，中國海關(guān)制定了一套稅單制度，包括免稅、退稅等，分別適用于征收、（在特殊條件下）返還子口稅，對子口稅和厘金各自適用的貨物加以區(qū)分。子口稅制度一直沿用到1930年。
（6）內(nèi)河貿(mào)易
最后，隨著1858年對長江航運外輪開放，并增開三個沿江口岸為商埠，監(jiān)管沿長江的航運和貿(mào)易也落人海關(guān)的職責(zé)范圍（見框1和框2）。如何恰如其分地勝任這一職能關(guān)系重大，因為其中存在很多向沿江太平軍提供軍火的非法貿(mào)易，以及與非通商口岸進行的非法貿(mào)易。開放沿江口岸也招來所在省份地方政府的反對，因為這些省份對內(nèi)陸轉(zhuǎn)運稅的依賴性很大；而中國海關(guān)u2014u2014僅負責(zé)管理通商口岸的對外貿(mào)易，當然也包括這些沿江口岸的對外貿(mào)易u2014u2014卻是一個隸屬于中央政府的機構(gòu)，地方政府無法對其施加影響。為了既能執(zhí)行條約關(guān)稅率、管理貿(mào)易，又能解決省級政府因此而產(chǎn)生的稅收流失，中國海關(guān)制定了《長江貿(mào)易章程》（1863年生效）。該章程對駛?cè)腴L江的海輪和只進行沿江貿(mào)易的內(nèi)河船只分別做出了規(guī)定。后續(xù)的條約增開了新的沿江商埠以及外籍船只可以裝卸貨物、上下乘客的u201c駐泊地u201d。鑒于駐泊地屬不對外開放的內(nèi)地，任何在此裝卸的貨物均需依照條約關(guān)稅率繳納厘金或子口稅。而在口岸，乘客在只有未攜帶任何應(yīng)納稅貨物的前提下才能自由上下船。